I januar 2004 præsenterede den nu hedengangne Strukturkommission sin betænkning om fremtidens organisering af den danske offentlige sektor. Efter fem måneders heftige politiske forhandlinger indgik et snævert flertal i Folketinget aftale om en strukturreform, der som bekendt reducerede antallet af kommuner fra 271 til 98, nedlagde amterne, vendte op og ned på opgavefordelingen og oprettede fem nye sundhedsregioner.